尼日利亞于1995年3月1日建立了有5147個組成的關稅體系。在該體系中，進口關稅介于5%-60%之間。2000年平均關稅從24%降至 12%，2001年，對500項關稅進行了修改，其中70項(大多數為農產品)平均上調至25%，430項平均降至10%以下，因而關稅總平均水平有所下降。進口關稅由尼日利亞海關征收，政府制定會計/審計事務所協作，經由指定商業銀行繳付至聯邦政府。

　　進口須交納稅費如下：

　　海關從價稅

　　港口附加費--已付關稅的7%

　　增值稅--CIF價+關稅+其他費用基礎上的5%

　　國家汽車委員會稅--進口車輛及另部件按CIF價的2%征收

　　糖稅--進口糖按CIF價的5%征收

　　共同體稅--征收0.5%的西非經濟共同體稅

　　管理費--按FOB1%征收

　　尼政府制定指定下列銀行收繳關稅：

　　First Bank Of Nigeria Plc

　　Afribank

　　Union Bank of Nigeria Plc

　　Universal Trust Bank

　　United Bank For Africa Plc

　　FSB International Bank

　　Diamond Bank

　　Zenith International Bank Limited

　　海關估價

　　尼日利亞海關征稅使用海關合作理事會標準(CCCN)。關稅即可從量也可從價征收，并以奈拉支付，進口關稅為非優惠關稅且對所有國家平等。進口貨物須由本地保險公司保險。

　　對政府認為有傾銷或非正常補貼行為、威脅現有或潛在國內產業的進口貨物將征收特別關稅。

　　因貨物被放棄、再出口或毀損時，已付關稅可以退還，但須在貨物脫離海關監管之前辦理。對毀損貨物的關稅退還，須從海關官員處獲得毀損證明。

　　對將運往另一國家但在尼日利亞已付清關稅的貨物，在海關證明證實后可退還關稅。

　　多支付的關稅可在12個月內向海關申請退款。

　　具商業價值的樣品，可有約束地免進口關稅，但實際操作上，海關官員常憑個人好惡拒絕免稅要求。

　　進口許可證

　　尼日利亞于1986年對貨物進口停止發行進口許可證以來，進口商必須使用M表。進口商需收到其銀行發放的M表后可開立不可撤銷信用證。自1999年9月1 日起，除個人財產、二手汽車和易腐敗物(如人類眼球、遺體、疫苗、期刊雜志等)可免于裝船前檢驗外，所有貨物進口均要求在原產國裝船前檢驗。

　　M表有用于外匯和非外匯兩種。負責發放M表的當地銀行將M表交到指定檢驗機構的尼日利亞辦事處，如果尼政府考慮取消裝船前檢驗，則將免于進行這一步。通常，M表和相應形式發票必須對進口貨物做出包括規格在內的正確描述。

　　出口管制

　　目前，尼尚未征收出口稅，下列商品尼禁止出口：

　　1. 生皮及皮革

　　2. 木材(無論加工與否)和未加工木頭，不包括家具部件、鐵路枕木、地板、天花板、門窗和扁平木具

　　3. 生棕櫚仁

　　4. 未加工的橡膠和橡膠塊

　　進出口文件

　　根據1996年4月1日生效的"尼日利亞進口指導原則"，出口到尼日利亞的所有商品必須獲得清潔結果報告(CRF)和進口關稅報告(IDR)。以前，1000美元以下的進口和列明為個人所用物品進口可免裝船前檢驗，關稅由指定銀行負責收繳。"原則"規定，無論進口的價值大小，無論是集裝箱還是散裝商品，包括個人物品，均須通過裝船前檢驗，但個人物品由裝船前檢驗機構證明可免征關稅。從1996年4月1日開始，港口提貨時，下列文件必須遞交給海關及征稅部門的官員：

　　1. 提單

　　2. 報關單

　　3. 經批準的M表

　　4. 海運保險單(由尼日利亞的保險公司出單)

　　5. 來自出口國的質量證書(食品和藥品)

　　6. 增值稅付款憑證

　　7. 由尼日利亞標準組織(SON)出具的、獲批準的產品質量和放行證書。

　　標簽和標記

　　船方在發貨清單遞交給海關前，須確保進口關稅報告IDR的號碼總是引用在所有進口裝船的裝船貨運清單上，對于空運貨物，航空公司須將IDR號碼注明在空運單上。

　　化驗分析證書須跟隨所有食品、藥品、化妝品和農藥等的進口。

　　衛生證書須跟隨某些動物產品、植物種子和土壤的進口。

　　所有進口貨物須以標條表明使用公制，兩種或多種標記的進口貨物將被沒收或拒絕進入。

　　禁止進口

　　活畜活雛雞

　　高粱和面粉

　　大包裝菜油

　　石膏

　　殺蟲劑

　　塑料用具

　　舊輪胎

　　用白磷制作的火柴

　　玩具手槍

　　游戲機

　　任何武器

　　標準

　　尼日利亞標準組織(SON)根據1971第56號法令設立，具有如下主要功能：

　　--組織測試以保證符合標準委員會指定的標準。

　　--編制所需標準化產品的存貨管理。

　　--編制尼日利亞標準規范列表清單。

　　--通過對可接受標準的推薦和主張，保障公眾和產業的利益。

　　--發展研發手段。

　　--注冊和制定標準、標記和規范。

　　--標準樣品的準備和分配。

　　--建立和維持一定數量的實驗室和機構。

　　--完成和出版綜合性科學或其他資料。

　　SON負責發放專利、商標和版權許可，尼食品藥品管理局NAFDAC則提供進口和國產食品、藥品、化妝品、醫療、水和化學產品的檢測和鑒定。