吉爾吉斯航空公司作為吉爾吉斯斯坦航空公司（吉爾吉斯斯坦:ЭйрКыргызстанАвиакомпаниясы，俄語：Авиакомпания?ЭйрКыргызстан?），是吉爾吉斯斯坦在比什凱克的航空公司。它運營到10個目的地的國內和國際定時服務，以及包機服務。 它的主要樞紐是比什凱克的馬納斯國際機場，在奧什奧什機場設有一個樞紐。該航空公司在歐盟禁止的航空承運人名單上.

吉爾吉斯航空成立于2001年4月，作為Altyn航空公司. 它于2006年7月28日更名為吉爾吉斯斯坦航空公司.接管國家航空公司吉爾吉斯斯坦航空公司.